吉他霉素不能直接用于治疗中耳炎，但可以辅助治疗由敏感菌株引起的中耳炎。
中耳炎主要是由于细菌或真菌感染所致，而吉他霉素为大环内酯类抗生素，对多种革兰氏阳性菌有较好的抗菌作用，适用于敏感菌株所引起的感染性疾病。虽然该药物对中耳炎主要致病菌有一定的抗菌效果，但由于其对于革兰氏阴性菌的作用较弱，且存在耐药等问题，故不作为首选或单独用药。中耳炎的病因及类型多样，治疗需针对具体病因选择合适药物，若为细菌感染，则建议使用青霉素类或头孢菌素类抗生素；若是真菌感染，则应选用抗真菌药物。
如果患者对吉他霉素过敏，则禁止使用该药物。此外，糖尿病患者需要特别注意血糖控制，以免因免疫功能下降导致感染风险增加。
在使用吉他霉素治疗中耳炎时，应注意可能出现的胃肠道不适、肝肾毒性等副作用，并定期监测病情变化及药物疗效。同时，患者还要保持良好的耳道卫生，避免水进入耳内，以防加重炎症。
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